تعتبر عملية مكافحة الافات بالمنطقة الغربية من اهم الخدمات التي تقدم للمرضى حيث انتشار مرض حمى الضنك و الذي ينتشر عن طريق البعوض.
فلابد من تنفيذ برنامج مخصص لمكافحة البعوض بالمستشفى و كذلك البيئة المحيطة بها حتى نضمن لمراجعي المستشفى التمتع بالأمان و عدم انتقال المرض له من مريض اخر يحمل المرض.
كما تعتبر عملية المكافحة في مناخ مدينة جده – حيث الحرارة و الرطوبة العاليتين – من اصعب الظروف التي تتم فيها عملية المكافحة و تحدي كبير للمحافظة على تلك البيئة خالية من الافات.